הגן האקולוגי על שם נח נפתולסקי
כמחצית משטח הגן הבוטני מוקדשת לגן האקולוגי על שם נח נפתולסקי (1883-1974), איש הצמחים והפרחים שעלה לארץ בעליה שניה, מת ערירי ותרם את עזבונו למען הקמת הגן הבוטני באוניברסיטת תל-אביב.
הגן מחולק לחלקות התואמות בתי גידול שונים בארץ. בחלקות משולבים הצמחים האופייניים לבתי הגידול שהן מייצגות יחד עם מינים נדירים בסכנת הכחדה ("מינים אדומים") האופייניים לאותה חלקה. מוזמנים להקליק על הקוביות על מנת להכנס לדפי החלקות.