המחלקה לביולוגיה מולקולרית ואקולוגיה של צמחים

נושאי מחקר

תכנית עבודת הגמר לתואר שני

תלמיד שהתקבל ללימודים במחלקה יגיש לוועדת המוסמכים המחלקתית תכנית לעבודת הגמר לא יאוחר מחצי שנה מתחילת לימודיו במחלקה. התכנית תאושר ע"י המנחה לפני הגשתה. הגשת התכנית במועד הנה תנאי להמשך הלימודים. טפסים להגשת התכנית ניתן לקבל במזכירות המחלקה. הוועדה תדון בתכנית על-סמך הערכה של אחד המורים שיגיש לוועדה את הערכתו בכתב.

נושאי המחקר במחלקה מתאימים ללימודים במסלולים: מדעי הצמח, אקולוגיה ואיכות הסביבה, ביוטכנולוגיה, גנטיקה ועוד...

נושא עבודת הגמר יקבע בהתייעצות בין התלמיד למנחה. התלמיד יבצע את העבודה בהנחיית המנחה ויקדיש את מירב המאמצים להשיג את מטרותיה עפ"י אמות מידה מדעיות מקובלות.

שם המרצה		נושאים לעבודות מחקר

פרופ. עדי אבני	1.	אפיון הרצפטורים האחראים על הפעלת מנגנון ההגנה בצמחים ולימוד אופן פעולתם.
	2.	ביוטכנולוגיה בצמחים – יצירת צמחים העמידים למזיקים
	3.	אפיון הסינגלים המובילים לאפופטוזיס (תמותת תאים מתוכננת) בצמחים
	4.	לימוד בקרת ייצור אתילן בעקבות עקות ביוטיות
	5.	אנדוציטוזה בצמחים הדומה והשונה מתאים אנימליים

פרופ. ניר אוהד	1.	ברור המנגנון האפיגנטי המושרה על יד חלבונים מקבוצת הפוליקומב (PcG) המשנים את מבנה הכרומטין כאמצעי לבקרת ביטוי גנטית. אנליזה בשיטות מולקולריות, גנטיות וביוכימיות
	2.	השוואה פונקציונלית של גנים מקבוצת הפוליקומב בין צמחים ירודים לצמחים עילאיים. השוואה מנקודת מבט אבולוציונית תוך שימוש בכלים גנטיים מולקולריים ומורפולוגיים
	3.	ברור תפקיד מטלציה של דנ ”א כמנגנון המבקר את התפתחות הצמח, בעזרת צמחים טרנסגנים, ואפיון מוטנטים

פרופ. רוני אלוני	1.	בקרה הורמונלית המכוונת דיפרנציאציה של רקמות הובלה בצמחים
	2.	דיפרנציאציה ובקרה הורמונלית של סרטן בצמחים
	3.	השפעות הדדיות בין טפיל ופונדקאי וביטוין במערכות ההובלה
	4.	התפתחות, מבנה ופיזיולוגיה של עצים
	5.	שיפור והעלאת יבולי סיבים בצמחים
	6.	מנגנוני אדפטציה של צמחים לסביבתם

פרופ. יהושוע אניקסטר	1.	גורמי מחלות של דגנים
	2.	ביולוגיה של פטריות חלדון התוקפות דגנים
	3.	שימוש בפטריות להדברה ביולוגית של עשבים רעים
	4.	שימוש בדגני בר קרובי צמחי התרבות כמקור עמידות למחלות צמחי התרבות
	5.	* יכול להנחות רק בשיתוף עם חבר סגל נוסף *

פרופ. ברוך אפל	1.	אפיון מנגנוני תנועה של וירוסים צמחיים
	2.	אפיון מנגנוני ויסות של טרנספורט מולקולות קטנות ומקרו-מולקולות דרך הפלסמודסמטא
	3.	אפיון ביוכימי ומולקולרי של חלבוני הפלסמודסמטא
	4.	תפקיד שלד התא בהתפשטות וירוסים
	5.	חקר יחסי מבנה-תפקוד של חלבוני תנועה ויראליים

פרופ. עמרם אשל	1.	בקרה של התארכות שורשים והסתעפויותיהם
	2.	מערכות שורשים כמקורות עמידות בפני תנאי עקה
	3.	אקולוגיה של הצומח במערכות חקלאיות

פרופ. סוון בר	1.	אקופיסיולוגיה ופוטוסינתזה של צמחי ים
	2.	פוטוסימביוזה של חסרי חוליות ימיים

פרופ. עדינה ברימן	1.	לימוד אינטראקציות בין שפרונים של חיטה וחלבונים אחרים
	2.	לימוד הקשר תפקיד-מבנה בחלבון השפרון FKBP בחיטה באורז וארבידופסיס וחשיבותם בהתפתחות

פרופ. יצחק ברש	1.	מנגנונים מולקולריים לפתוגניות ולהתפתחות גידולים סרטניים בחיידקים פתוגנים על צמחים
	2.	אפיון ורגולציה של גנים לפתוגניות בחיידקים
	3.	אפיון מיקרואורגניזמים אנדופיטים בדגניים
	4.	* יכול להנחות רק בשיתוף עם חבר סגל נוסף *

פרופ. מיכאל גורביץ	1.	חקר האינטראקציה בין רעלני עקרבים לקולטניהם בתעלות נתרן
	2.	יחסי מבנה-תפקוד, קביעת האתר הפעיל וברור מנגנון הפעולה של הרעלנים
	3.	יחסי מבנה-תפקוד תעלות נתרן רקומביננטיות: מחקר אלקטרופיסיולוגי ומולקולרי
	4.	חשיפת הבסיס המיבני לבררנות התפקודית של רעלנים כלפי תעלות נתרן שונות
	5.	הנדסת אתרים פעילים של רעלנים על שלד חלבוני מוקטן
	6.	חקר האנזים Rubisco באמצעות גישה משולבת פיסיולוגית, ביוכימית ומולקולרית
	7.	הנדסה גנטית של האנזים מציאנובקטריה
	8.	חקר הבקרה על פעילות ועל פרוק האנזים ע"י פוטנציאל חמצון-חיזור
	9.	חשיפת המנגנון לבקרת האנזים ע"י פוספט אנאורגני
	10.	מערכת ציאנובקטריאלית המאפשרת סלקציה של אנזים משופר
	11.	פענוח תפקוד ומבנה הקרבוכסיזום

פרופ. אביה זילברשטיין	1.	נושאים שונים בביוטכנולוגיה וגנטיקה מולקולרית של צמחים
	2.	אפיון והחדרה לצמחים של גנים המעורבים בהקניית עמידות לעקות יובש, מלח וקור
	3.	חקר גנים בעלי יכולת של הקניית עמידות בצמחים כנגד פתוגנים
	4.	חקר מעבר האותות המושרה ע"י עקות אוסמוטיות והתקשורת בינו לבין בקרת המטבוליזם של חומצות אמינו וסוכרים
	5.	פרולין ומעורבותו בתגובה לעקות שונות וכן לימוד תפקידם של חלבונים עתירי פרולין
	6.	פקטורי שעתוק המעורבים בביטוי של מסלולי היצירה של חומצות אמינו שמקורם בחומצה גלוטמית בצמחים

פרופ. דניאל חיימוביץ	1.	תפקידו של הקומפלקס CSN בתגובה החיסונית ובמחזור התא בדרוזופילה
	2.	הקשר בין CSN לבין תרגום חלבונים בארבידופסיס
	3.	תפקידם של חלבונים קושרי CSN בארבידופסיס
	4.	בירור התפקידים הגלובליים של CSN ע"י גישות ביו-אינפורמטיות

פרופ. שאול ילובסקי	1.	משפחת חלבוני ה-ICR ותפקידה בהעברת אותות מושרים על ידי RACs בצמחים
	2.	חלבונים שמבקרים פעילות RAC GTPases בצמחים
	3.	בקרת מחזור התא ודיפרנציאציה ע"י RACs צמחיים
	4.	תפקוד RACs ביצירת הפולאריות בתאים צמחיים
	5.	זיהוי פרנילצית חלבונים בשיטות פרוטאומיות
	6.	פיתוח שיטות לבחינת אינטראקציות בין חלבונים בצמחים
	7.	המחקר במעבדה משתמש בגישה המשלבת את השיטות המודרניות ביותר לאנליזה מולקולרית וביוכימית ומיקרוסקופית יחד עם גישות קלאסיות לאפיון מורפולוגי ופיסיולוגי של צמחים

ד"ר יעקב ליפקין	1.	פלוריסטיקה ואקולוגיה של אצות-ים, עשבי-ים ואצות מים מתוקים
	2.	טחבי מים מתוקים: גנטיקה; עמידות למלח
	3.	* יכול להנחות רק בשיתוף עם חבר סגל נוסף *

פרופ. גואידו ססה	1.	חקר מנגנונים מולקולריים של עמידות צמחים לגורמי מחלה
	2.	אפיון ביוכימי ומולקולרי של גנים צמחיים לעמידות מפני מחלות
	3.	חקר מקיף של ביטוי גנים בצמחים עמידים למחלות
	4.	תפקיד זירחון חלבונים במעברי אותות הקשורים לעמידות
	5.	אפיון של גנים חידקיים לפטוגניות ולחוסר פטוגניות

ד"ר יובל ספיר	1.	בידוד רבייתי ויצירת מינים
	2.	גנטיקה של שמירת טבע במינים נדירים
	3.	יחסי מאביקים-פרחים ואבולוציה של הפרח
	4.	אבולוציה של צבעי פרחים באירוסים

פרופ. הלל פרום	1.	אפיון גנים המקדדים לחלבוני שעתוק-קושרי סידן/קלמודולין, ותפקידם בתגובת הצמח לעקות
	2.	בקרה מטבולית על ידי סידן/קלמודולין בתגובה לעקות
	3.	אפיון מנגנונים מולקולריים המעורבים בתגובת הצמח למתכות כבדות
	4.	ביוטכנולוגיה בצמחים: הנדסה גנטית לשיפור עמידות צמחים לעקות סביבתיות
	5.	אנליזה גנטית, מולקולרית ופיסיולוגית של מנגנון חישת המים בצמחים איפיון מוטנטים בגנים המקדדים לחלבוני שעתוק בצמחים בקרת ביטוי גנים בצמחים אפיון מנגנונים מולקולריים המעורבים בתגובת הצמח למתכות כבדות

פרופ. יעקב פרידמן	1.	צמחי תבלין בצמחיה הטבעית של ישראל ווריאביליות גנטית, תכולה והרכב שמנים אתריים בתנאי שדה ובתנאים מבוקרים, היבטים אקולוגיים ורפואיים
	2.	* יכול להנחות רק בשיתוף עם חבר סגל נוסף *

פרופ. מרסלו שטרנברג	1.	אקולוגיה של צמחים
	2.	חקר צומח ארץ ישראל
	3.	לימוד השפעת שינויי אקלים על דינאמיקה של חברות צומח ותפקוד אקוסיסטמות
	4.	חקר השפעת רעייה על דינאמיקת מאגר זרעים בקרקע וחברות צומח
	5.	אפיון קבוצות תפקודיות בצמחים (Plant functional types)
	6.	לימוד אסטרטגיות נביטה

פרופ. עמיר שרון	1.	רגולציה מתווכת מיטוכונדר יה של מוות תאי ואוטופגיה בפטריות
	2.	איתור של פטריות אנדופיטיות מועילות ויישומן לשיפור צמחי תרבות
	3.	בידוד אפקטורים משרי מוות תאי בצמחים מפטריות פתוגניות
	4.	תפקיד מוות תאי מתוכנת בווירולנטיות של הפתוגן ההומני אספרגילוס פומיגטוס