המחלקה למיקרוביולוגיה מולקולרית ולביוטכנולוגיה

נושאי מחקר

שם המרצה		נושאים לעבודות מחקר

פרופ. יאיר אהרנוביץ	1.	האנזים ריבונוקלאוט יד רדוקטז בחיידקים גרם חיוביים פעילות, בקרה, יחסי מבנה ותפקוד
	2.	ביוסינטיזה של גלוטטיון בחיידקים ע"י חלבון מולטימודולרי
	3.	זיהוי מטרות חדשות לפעילות חורים אנטיביוטיים לצורך פיתוח תרופות חדשות
	4.	מטבוליזם חימצון-חיזור של תיולים ביולוגיים בחיידקים

ד"ר אביגדור אלדר	1.	רשתות גנטיות של התמיינות ותקשורת בחיידקים
	2.	אבולוציה של התפתחות ושיתוף פעולה ותקשורת בחיידקים
	3.	עמידות לתרופות נוגדות תקשורת בחיידקים
	4.	שונות לא גנטית ורעש בביטוי חלבונים
	5.	מודלים מתמטיים של התפתחות ותקשורת בין תאית

פרופ. איתי בנהר	1.	נוגדנים רקומביננטיים ככלים לזיהוי ואפיון חלבונים בעלי ערך מחקרי, דיאגנוסטי או תרפויטי
	2.	מעכבים לפרוטיאזות נגיפיות: בידוד , אפיון ויישום
	3.	טכנולוגית חלבוני-איחוי ככלי לשיפור חלבונים בלתי יציבים
	4.	נוגדנים תוך-תאיים ככלים לויסות תוך תאי של פעילויות אנזימטיות והעברת אותות
	5.	בקטריופאזים מהונדסים כנושאי תרופות וגנים
	6.	יישומים תרפוייטיים של בקטריופאז’ים מוכוונים נושאי תרופות
	7.	נוגדנים רקומביננטיים ככלים לזיהוי ואפיון חלבונים בעלי ערך מחקרי, דיאגנוסטי
	8.	נוגדנים תוך-תאיים ככלים לויסות תוך תאי של פעילויות אנזימטיות והעברת אותות
	9.	ננו-חלקיקים מוכווני-נוגדנים כנושאי תרופות וגנים
	10.	בידוד ואפיון נוגדנים בי-ספציפיים
	11.	בידוד ואפיון מולקולות Theranostic מבוססות על נוגדנים

פרופ. דוד גוטניק	1.	ביופולמרים - ייצור, גנטיקה, ביולוגיה מולקולרית, ביוסינתיזה הנדסה ויישום
	2.	ביודגרזציה של זיהום הסביבה
	3.	מיקרוביולוגיה של הנפט
	4.	הבסיס הגנטי להיווצרות מבנים מורכבים במושבות חיידקים

פרופ. אורי גופנא	1.	The origins of eukaryotes
	2.	The origins of eukaryotic sex
	3.	Microbial ecology of marine invasive species
	4.	Microbial ecology of the human gut in health and disease
	5.	Horizontal gene transfer in microbial evolution
	6.	Virulence factors of pathogenic E. coli strains
	7.	Computational evolutionary genomics of prokaryotes
	8.	synthetic biology for the study of evolutionary questions

פרופ. אהוד גזית	1.	מודלים פפטידיים וחלבונ יים למחלות הנובעות מחוסר יציבות או קיפול שגוי של חלבונים
	2.	היבטים ביוכימיים וביופיזיקליים של מנגנוני toxin-antidote בחיידקים ובקטריופאג'ים
	3.	תפקיד היציבות התרמודינמית בתהליכי דגרדציה של חלבונים
	4.	היכרות ספציפית בין חלבון ל- DNA: הבסיס המולקולרי והפעילות הפיזיולוגית
	5.	מנגנונים פיזיולוגיים המבוססים על חוסר יציבות יחסי של חלבונים
	6.	שימוש במודלים מולקולריים ובביואינפורמטיקה להבנת הבסיס האנרגטי ליציבות תרמודינמית של חלבונים

ד"ר ערן הלפרין	1.	גנטיקה חישובית - פיתוח שיטות חישוביות לאנליזה של מערכות ונתונים גנטיים
	2.	חיפוש ווריאנטים גנטיים המהווים גורמי סיכון למחלות
	3.	גנטיקה של אוכלוסיות הומניות - הבנת ההיסטוריה האנושית דרך ה-DNA והבנת תהליכים מולקולרים ואבולוציונים באמצעות השונות הגנטית באוכלוסיה

ד"ר ענת הרשקוביץ	1.	Host pathogen interactions.
	2.	Virulence factors of the intracellular bacterial pathogen Listeria monocytogenes.
	3.	Studying innate immune responses to Listeria monocytogenes infection.

פרופ. רפאל למד	1.	אזורי חלבון קושרי צלולוז ו/או המי צלולוז וחשיבותם בפירוק דופן תא צמחי על ידי חיידקים
	2.	תפקוד אנזימים וחלבוני ארגון ב-צלולוזום של חיידקים שונים
	3.	הכנת תלכידי אנזימים בעלי פירוק משופר של צלולוז

פרופ. משה מברך	1.	גנטיקה של חיידקים אוהבי מלח
	2.	הנדסה גנטית של חלבונים

פרופ. דני סגל	1.	ניתוח גנטי מולקולרי של פקטורי שיעתוק בדרוזופילה
	2.	גנים הומולוגיים לאונקוגנים בדרוזופילה
	3.	תפקידו של קומפלכס חלבונים צמחי בהעברת אותות בבעלי חיים
	4.	גנטיקה מולקולרית של endocytosis בדרוזופילה
	5.	שימוש בדרוזופילה כמודל למחלות אדם ולפיתוח תרופות (רוגמה: מחלות נוירודגנרטיביות, סרטן).

פרופ. גיל סגל	1.	גנטיקה מולקולרית של יחסי פתוגן-מאכסן
	2.	ניתוח גנטי מולקולרי של מנגנוני בקרה בחיידקים פתוגנים
	3.	התרומה של Horizontal gene transfer לאבולוציה של מערכות פתוגניות
	4.	אנליזה גנומית, מולקולרית ותאית של מערכת הפתוגניות בחיידקים Legionella ו- Coxiella
	5.	תפקידם של חלבונים המועברים לתאי מאכסן (effector proteins) במהלך הדבקה
	6.	שימוש במערכת של שמר האפיה למחקר חלבונים מחיידקים פתוגנים

פרופ. בקה סולומון	1.	מחלות קונפורמטיביות כגון: אלצהיימר ומחלות הקשורות בפריונים
	2.	נוגדנים לחקר קונפורמציה של חלבונים
	3.	שימוש בנוגדנים לדיאגנוזה
	4.	שימוש בנוגדנים לקיבוע ועיצוב אנזימים
	5.	נוגדנים כ - Chaperones

פרופ. גדעון פלמינגר	1.	יחסי תפקוד-מבנה בחלבונים תלויי-סידן
	2.	אבולוציה כימית של פפטידים קטליטיים בתהליכים של ראשית החיים
	3.	פיתוח מערכות כרומטוגרפיה מתקדמות בדגש על כרומוטוגרפית זיקה
	4.	חלבונים קושרי Ti – מבנה ותפקוד

פרופ. עמיחי פרימן	1.	Protein crystals engineering
	2.	Protein based nano-structured composite materials
	3.	Biomedical applications of enzymes

פרופ. מרטין קופייק	1.	מנגנונים השומרים על יציבות הגנום האוקריוטי.
	2.	אפיון של פעילות גנים לתיקון דנ"א [DNA repair] באוקריוטים
	3.	גנטיקה מולקולרית של טלומרים: איך אורכם נקבע?
	4.	Checkpoints והשמירה על יציבות הגנום
	5.	רקומבינציה בין רצפים חוזרים. מדוע אין הרבה אברציות כרומוזומיות?
	6.	מנגנון הרקומבינציה: איך מתקנים כרומוזום שנשבר?
	7.	ביולוגיה של מערכות ( systems biology): הסתכלות על גנומים ממבט הציפור.
	8.	ביולוגיה וגנטיקה מולקולריות של השמר

פרופ. יוג'ין רוזנברג	1.	Bacteria in the health and disease of corals
	2.	Petroleun bioremediation
	3.	Antibiotic and biofilms
	4.	Bioemulsifiers

פרופ. אליאורה רו	1.	גנטיקה של אלימות בחיידקים
	2.	מנגנוני בקרה גלובלית בחיידקים
	3.	בקרה של ביטוי פרומוטורים
	4.	שימוש בחיידקים לפתרון בעיות סביבתיות

פרופ. יהודית רשפון	1.	חיישנים ביולוגיים: אלכטרוכימיים, פיאזואלקטריים ואופטיים
	2.	אלקטרודות אנזימטיות
	3.	אימונואלקטרודות
	4.	ביוחיישנים לקביעת זיהומים במזון ובסביבה המבוססים על נוגדנים, אנזימים ותאים שלמים
	5.	חיישנים אלקטרוכימיים לקביעת חומרים המשפעלים את המערכת האנדוקרינית
	6.	חיישנים אלקטרוכימיים לזיהוי וכימות חיידקים ווירוסים
	7.	תאי דלק ביולוגים ויישומם בטיהור שפכים