מבוא לביואינפורמטיקה (0455.3066)
עודכן: 11.10.2018
שם הקורס באנגלית: Introduction to Bioinformatics
סוג: שיעור | ||||||
מספר קורס | סמסטר | יום | משעה | עד שעה | בניין | חדר |
0455.3066.01 | א | ב | 10:00 | 12:00 | בריטניה | 005 |
0455.3066.02 | א | ג | 15:00 | 17:00 | בריטניה | 014 |
סוג: תרגיל | ||||||
מספר קורס | סמסטר | יום | משעה | עד שעה | בניין | חדר |
0455.3066.03 | א | ג | 13:00 | 14:00 | שרמן | 003 |
0455.3066.04 | א | ג | 15:00 | 16:00 | שרמן | 003 |
0455.3066.05 | א | ד | 09:00 | 10:00 | שרמן | 002 |
0455.3066.06 | א | ד | 16:00 | 17:00 | בריטניה | 005 |
סילבוס:
מטרת הקורס הינה הכרת המונחים הבסיסיים של תחום הביואינפורמטיקה והרעיונות המרכזיים אשר נמצאים בשימוש נרחב. במסגרת הקורס נלמד להשתמש בתכנה R. בקורס יודגש השימוש הגובר והולך במסדי נתונים גדולים (Big data) לצורך תגליות ביולוגיות. בקורס ילמדו הנושאים הבאים:
- מבוא: ביולוגיה חישובית – מהפכה במדעי החיים במאה ה 21 (שבוע 1)
- עימוד (alignment) וחיפוש הומולוגים ע”י בלסט (שבוע 1-2)
- עצים פילוגנטיים ושימושם לחקר האבולוציה (שבוע 3-4)
- גנטיקה בעידן הביואינפורמטיקה (שבוע 5-6)
- למידה חישובית, קיבוץ (clustering), מבחני העשרה (שבוע 7-8)
- למידה חישובית, סיווג (classification) (שבוע 9-10)
- רשתות ביולוגיות: תכונות גלובליות, מוטיבי רשת (שבוע 11-12)
- חזרה ותרגול נוסף (שבוע 13)
דרישות קדם: ביולוגיה של התא, ביוכימיה א, גנטיקה, סטטיסטיקה
נוכחות חובה
הרכב ציון:
60% מבחן סופי, 40% הגשת תרגילים חובה.
מטלת סיום: בחינה בכתב